Lùi hiệu lực thi hành của Bộ Luật hình sự, Bộ Luật tố tụng hình sự, Luật tổ chức cơ quan điều tra hình sự, Luật thi hành tạm giữ, tạm giam từ ngày 1/7/2016 đến ngày Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Bộ Luật hình sự có hiệu lực thi hành, trừ một số nội dung sau:
Nghị quyết quy định: Kể từ ngày 1/7/2016, thực hiện các quy định có lợi cho người phạm tội tại khoản 3 Điều 7 Bộ Luật hình sự năm 2015 và điểm b khoản 1 Điều 1 Nghị quyết số 109/2015/QH13 về việc thi hành Bộ Luật hình sự; tiếp tục áp dụng khoản 2 Điều 1 và các quy định khác có lợi cho người phạm tội tại Nghị quyết số 109. Áp dụng các quy định của Bộ Luật tổ tụng hình sự năm 2015 để thi hành các quy định có lợi cho người phạm tội của Bộ Luật tố tụng hình sự năm 2015 và Nghị quyết số 109.
Nghị quyết cũng nêu rõ, tiếp tục áp dụng Bộ Luật hình sự số 15/1999/QH10 (được sửa đổi, bổ sung một số điều theo Luật số 37/2009/QH12), Bộ Luật tố tụng hình sự số 19/2003/QH11, Pháp lệnh tổ chức điều tra hình sự số 23/2004/PL-UBTVQH11 (được sửa đổi, bổ sung một số điều theo Pháp lệnh số 30/2006/PL-UBTVQH11 và Pháp lệnh số 09/2009/PL-UBTVQH12), Nghị định số 89/1998/NĐ-CP ban hành Quy chế về tạm giữ, tạm giam (được sửa đổi, bổ sung một số điều theo Nghị định số 98/2002/NĐ-CP và Nghị định số 09/2011/NĐ-CP của Chính phủ) cho đến ngày Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Bộ Luật hình sự có hiệu lực thi hành.
Nghị quyết số 144/2016/QH13 ngày 29/6/2016 của Quốc hộ có hiệu lực thi hành từ ngày 30/6/2016.
Trước đó, khi Bộ luật Hình sự năm 2015 được Quốc hội thông qua, nhiều cơ quan tư pháp, công an, viện kiểm sát đã phát hiện nội dung của Bộ luật có nội dung sai sót và đã phản ánh về Ủy ban Tư pháp của Quốc hội. Ủy ban Thường vụ Quốc hội đã chỉ đạo Ủy ban Tư pháp của Quốc hội phối hợp với các cơ quan chức năng, rà soát ngay các quy định của Bộ Luật Hình sự năm 2015. Trên cơ sở rà soát, Bộ luật Hình sự năm 2015 có một số nội dung sai sót chủ yếu về mặt kỹ thuật, không sai về đường lối, quan điểm, chủ trương của Đảng, Nhà nước về hình sự. Nhưng những điểm sai sót về mặt kỹ thuật này lại có ảnh hưởng đến việc thực hiện Bộ luật. Chính vì vậy đây là nguyên nhân chính phải hoãn thời hạn thi hành Bộ luật Hình sự năm 2015 và 3 Luật có liên quan gồm: Bộ Luật tố tụng hình sự, Luật tổ chức cơ quan điều tra hình sự, Luật thi hành tạm giữ, tạm giam